申请/专利权人：扬州大学

申请日：2023-11-21

公开（公告）日：2024-02-06

公开（公告）号：CN117524303A

主分类号：G16B20/20

分类号：G16B20/20;G16B30/10;G16B40/00;G16B50/00;G06F18/2135;G06N3/126;G06N5/01

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.02.27#实质审查的生效;2024.02.06#公开

摘要：本发明公开了一种优化濒危鹅保种群体遗传结构的方法。该方法只需人为采血提取血液样本DNA，利用全基因组重测序对群体特定个体进行基因组建库、测序，对测得的原始reads双端序列进行数据评估后比对到参考基因组上，对SNP进行过滤后，根据种内平均SNP数进行淘汰，再使用得到的SNP标记进行PCA、系统进化树、群体结构等分析。该方法不仅实用方便，而且对种鹅的伤害小，可用于濒危鹅群体的选育，具有良好的应用前景。

主权项：1.一种优化濒危鹅保种群体遗传结构的方法，其特征在于，包括以下步骤：1提取待测鹅血液DNA，每个待测品种至少提取15个公鹅样本；2构建文库；3对文库中的DNA片段进行测序及数据质控；4对质控后的数据比对到参考基因组上并进行变异检测；5对步骤4中检测到的变异位点进行个数统计、群体遗传多样性分析及绘制遗传结构图谱，分析目标群体的近交系数，每个品种内先淘汰SNP位点数量小于该品种平均SNP位点数的个体，再淘汰遗传距离较近的个体，即得纯种个体基因频率稳定值高的个体。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 扬州大学 一种优化濒危鹅保种群体遗传结构的方法

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