申请/专利权人：布罗德研究所股份有限公司;麻省理工学院

申请日：2022-05-27

公开（公告）日：2024-04-02

公开（公告）号：CN117813395A

主分类号：C12Q1/6841

分类号：C12Q1/6841

优先权：["20210528 US 63/194,536"]

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.19#实质审查的生效;2024.04.02#公开

摘要：本公开提供了用于绘制细胞中基因和蛋白质表达图谱即，同时绘制同一细胞内基因和蛋白质表达图谱的方法和系统。本公开还提供了用于诊断受试者的疾病或病症例如，神经病症如阿尔茨海默病的方法。本公开还提供了筛选能够调节基因和或蛋白质表达的候选药剂的方法。本公开还提供了用于在有此需要的受试者中治疗疾病或病症如阿尔茨海默病的方法。本公开还描述了可用于执行本文所述的方法的多种寡核苷酸探针，以及包含本文所述的任何寡核苷酸探针的试剂盒。另外，本公开提供了用于鉴定至少一个图像中细胞类型的空间变化的方法、装置和非暂时性计算机可读存储介质。

主权项：1.绘制细胞中基因和蛋白质表达图谱的方法，所述方法包括：a使所述细胞与一对或多对寡核苷酸探针接触，其中每对寡核苷酸探针包含第一寡核苷酸探针和第二寡核苷酸探针，其中i所述第一寡核苷酸探针包含与所述第二寡核苷酸探针互补的部分、与感兴趣的核酸互补的部分、第一条形码序列和第二条形码序列；和ii所述第二寡核苷酸探针包含与所述感兴趣的核酸互补的部分、与所述第一寡核苷酸探针互补的部分和条形码序列，其中所述第二寡核苷酸探针的所述条形码序列与所述第一寡核苷酸探针的所述第二条形码序列互补；b将所述第一寡核苷酸探针的5’末端和3’末端连接在一起以产生环状寡核苷酸；c使用所述第二寡核苷酸探针作为引物进行滚环扩增以扩增所述环状寡核苷酸，从而产生一种或多种串联的扩增子；d使所述细胞与一种或多种检测剂接触，其中每种检测剂结合感兴趣的蛋白质；e将所述一种或多种串联的扩增子和所述一种或多种检测剂嵌入聚合物基质中；f使嵌入所述聚合物基质中的所述一种或多种串联的扩增子与包含与所述第一寡核苷酸探针的所述第一条形码序列互补的序列的第三寡核苷酸探针接触；和g对嵌入所述聚合物基质中的所述一种或多种串联的扩增子和嵌入所述聚合物基质中的所述一种或多种检测剂进行成像以确定所述感兴趣的核酸和所述感兴趣的蛋白质在所述细胞内的位置，并任选地绘制基因和蛋白质表达图谱。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 布罗德研究所股份有限公司;麻省理工学院 转录状态和蛋白质组织学的联合绘图

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