申请/专利权人：黑龙江省农业科学院畜牧研究所

申请日：2023-11-09

公开（公告）日：2024-01-09

公开（公告）号：CN117363750A

主分类号：C12Q1/6888

分类号：C12Q1/6888;C12Q1/6874;C40B50/06

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.01.26#实质审查的生效;2024.01.09#公开

摘要：一种可用于民猪选育的15K液相芯片制备方法及基因分型方法，本发明要解决目前缺少地方猪保种和选育用芯片、固相芯片不灵活的问题。本发明的民猪15K液相芯片由独立包装的民猪15K探针混合液和杂交捕获试剂构成，所述民猪15K探针为是针对民猪全基因组序列筛选的SNP位点设计并合成的核苷酸序列。利用本发明制备的民猪15K液相芯片与待测民猪DNA高通量测序文库混合，捕获待测民猪DNA高通量测序文库中包含目标位点的DNA片段进行扩增和纯化，产物经过高通量测序后，将测序结果回帖到猪参考基因组上进行比对，从而获取待测民猪的基因组基因分型。本发明可用于民猪保种和选育工作，解决我国目前缺少专门针对地方猪品种选育用芯片的问题。

主权项：1.一种可用于民猪选育的15K液相芯片制备方法，其特征在于，所述的液相芯片由民猪15K探针混合液和杂交捕获剂构成；所述的15K液相芯片制备方法包括以下步骤：步骤一、选择民猪，提取耳组织DNA并储存备用；步骤二、对提取的民猪耳组织DNA进行全基因组重测序，在全基因组水平筛选SNP位点，建立能够覆盖民猪群体的SNP位点集合，获得了15000个SNP位点；步骤三、对所筛选出的15000个SNP位点，遵循液相捕获技术的探针设计原则，分别合成两条长度为110bp，5’端带有生物素基因修饰的DNA核苷酸序列，并定义为探针；步骤四、将步骤三合成后的探针进行等摩尔质量混合，利用EDTA和Tris-HCl混合液定容，得到15K探针混合液，并与杂交捕获试剂组合使用，得到所述的可用于民猪选育的15K液相芯片。

全文数据：

权利要求：

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