申请/专利权人：阅尔基因技术(苏州)有限公司;上海阅尔基因技术有限公司

申请日：2024-01-09

公开（公告）日：2024-02-23

公开（公告）号：CN117587131A

主分类号：C12Q1/6886

分类号：C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12N15/10

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.03.12#实质审查的生效;2024.02.23#公开

摘要：本发明涉及ctDNA检测领域，提供了用于动态监测ctDNA的检测方法及其应用，包括：DNA样本、扩增反应、添加扩增反应适配器、NGS库，通过DNA取样后进行mBDA后再进行纯化柱，而后形成扩增反应，再为PCR添加适配器后进行二次纯化柱，而后再为扩增反应添加适配器后，再为PCR添加索引，对安瓿珠尺寸进行选择，最后入NGS库；本发明通过扩增反应、纯化柱mBDA的运用解决了实体肿瘤MRD检测难度大成本高等问题。

主权项：1.用于动态监测ctDNA的检测方法，其特征在于，包括：S1:DNA取样：（1）先将细胞裂解与细胞裂解缓冲液裂解细胞膜，再将脂质被洗涤剂和表面活性剂分解；（2）通过添加蛋白酶消化蛋白质，再通过添加RNase消化RNA，随后通过加入浓盐然后离心分离细胞碎片、消化蛋白质、脂质和RNA；（3）最后用冰冷的乙醇或异丙醇乙醇沉淀DNA，醋酸钠的离子强度可用于改善沉淀，沉淀的DNA在最终溶液中呈线状；S2:扩增反应，在引物的指导下由酶催化的对特定模板的扩增反应，是模拟体内DNA复制过程，少量DNA中难以检测出ctDNA的问题，从复制扩增过程需要通过其他过程展现出来；S3:附加扩增反应适配器，附加一个适配器将两个扩增反应设备与NGS库设备连接起来并与二者电流相匹配，能够使扩增反应设备与NGS库设备进行协同运作；S4:输入NGS库，将扩增反应后的DNA输入库内，通常分为四个步骤，DNA或RNA片段剪切、末端修复和连接、文库扩增和纯化和文库质控，之后再对ctDNA及肿瘤治疗过程进行监测。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 阅尔基因技术(苏州)有限公司;上海阅尔基因技术有限公司 用于动态监测ctDNA的检测方法及其应用

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